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于单分子长读取测序的高分子量基因组DNA的提取方法

阅读次数:2321 发布时间:2016/11/24 9:11:47

复杂基因组从头测序是研究人员寻求高质量参照序列的主要挑战,许多从头组装都是基于短序列,组装成片段的基因组序列。第三代测序技术的读取长度大于10 Kb,这将有利于复杂基因组的组装,但是这些技术要求高分子量的基因组DNA,常用的基因组DNA提取方法所提取到的基因组DNA可用于获取较小片段并进行短读取测序,但是这些基因组DNA并不适用于第三代测序技术。利用细菌人工染色体构建基因文库的方法也许适用,但是这些方法不但耗时,而且用于这些方法的试剂盒较为昂贵。这里,法国科学家Baptiste Mayjonade等人提供了一种快速廉价的从细菌、植物和动物中提取高分子量基因组DNA的方法。这一方法已通过验证,以向日葵叶子为样本,其平均读取长度为12.6 Kb,读取长度为80 Kb
 
原文:
Baptiste Mayjonade, Jérôme Gouzy, Cécile Donnadieu et al, Extraction of high-molecular-weight genomic DNA for long-read sequencing of single molecules. BioTechniques 61:203-205 (October 2016).

原创作者:北京鼎国昌盛

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